이 절의 본당(자오도)은 일본에서 두 번째로 큰 목조 건물로, 위엄 있는 표정을 한 세 구의 거대한 청색 자오 곤겐 상을 모시고 있으며, 이 불상들은 봄과 가을의 특별 개방 기간에만 일반에 공개됩니다.

겨울철에는 본당 바닥이 너무 추워져서 방문객들이 참배를 수행의 한 형태로 묘사할 정도이며, 난방이 되지 않는 이 신성한 공간의 온도는 약 2°C까지 떨어집니다.

金峯山寺는 남조시대에 고다이고 천황의 본거지 역할을 했으며, 사찰의 강력한 승병들이 나라와 교토의 대사찰들과도 견줄 만한 군사적 지원을 제공했습니다.