この神社の名前は「亀」（かめ）とその所在地である亀有地区を組み合わせたもので、その地名自体が亀のモチーフを参照しており、日本の民間信仰における長寿と保護への多層的なつながりを生み出しています。

明治維新の時代、亀有香取は地域の商人コミュニティとの強い結びつきを保つことで、多くの小規模な神社を破壊した廃仏毀釈の波を乗り越えることができました。この商人たちは神社の祈祷式に依存していたのです。