O santuário exibe um raro fenômeno natural: uma única árvore de ameixa que floresce ao mesmo tempo com flores brancas e rosadas, deixando os visitantes a pensar se é obra da natureza ou enxertia humana.

O festival anual da ameixa reúne uma mistura eclética de entretenimento tradicional e moderno: cerimônias do chá e dança japonesa, demonstrações de segurança da polícia e eventos do escritório de impostos.

Na época alta das flores de ameixeira, tantos estudantes penduram placas de oração por e-mail para o sucesso nos exames que transbordam os suportes e literalmente tocam o chão, criando tapetes de desejos por todo o recinto do santuário.

Apesar de ter um terreno menor que o vizinho Santuário Nezu, Yushima Tenmangu tem mais de 300 árvores de ameixa de variedades diversas, sendo um dos pontos de maior concentração para ver flores de ameixeira em Tóquio.