Le sanctuaire a été fondé en 1212 par un samouraï qui a fui après l'assassinat de son seigneur, inspiré par un rêve où il a reçu un miroir lumineux du dieu de la guerre lui-même.

Un site Jomon vieux de 5 000 ans a été découvert sous le sanctuaire en 1950, et vous pouvez encore voir une maison de fosse reconstruite montrant comment vivaient les premiers habitants de Tokyo.

Des lanternes en pierre le long du chemin ont été offertes par des résidents contraints de partir lorsque l'armée impériale a construit un vaste terrain d'entraînement ici en 1909—elles sont appelées 'Monuments d'Adieu.'

Malgré la dense forêt au cœur de Tokyo, les visiteurs d'été signalent presque aucune piqûre de moustique grâce au microclimat unique créé par les arbres de la colline.